Cùng với việc triển khai nhiệm vụ thu ngân sách nhà nước (NSNN), công tác cải cách thủ tục hành chính (TTHC) được cơ quan thuế các cấp đặc biệt quan tâm. Trong đó, Tổng cục Thuế đã kịp thời xây dựng các kế hoạch hành động và tổ chức thực hiện đúng với tinh thần các Nghị quyết của Chính phủ. Phấn đấu đến năm 2020 Việt Nam là 1 trong 4 nước đứng đầu khu vực Đông Nam Á được xếp hạng có mức độ thuận lợi về thuế.
Để thực hiện mục tiêu, Tổng cục Thuế đã xây dựng 3 kế hoạch hành động để triển khai Nghị quyết 19, Nghị quyết 35 và Nghị quyết số 36a của Chính phủ. Kết quả thực hiện các kế hoạch hành động được xem là thước đo để đánh giá mức độ hoàn thành nhiệm vụ, bình xét thi đua khen thưởng năm 2016 đối với các tập thể, cá nhân.
Tính đến nay, bước đầu cho thấy các nhiệm vụ, giải pháp của các kế hoạch hành động đã được triển khai theo đúng tiến độ và lộ trình đề ra. Hầu hết các đơn vị trong toàn ngành Thuế đã đồng loạt hưởng ứng, kịp thời cụ thể hóa thành các công việc, nhiệm vụ và giao trực tiếp cho từng bộ phận, cán bộ triển khai thực hiện.
Cùng với việc triển khai các nội dung của kế hoạch hành động, Tổng cục trưởng Tổng cục Thuế còn ban hành Chỉ thị số 01/CT-TCT chỉ đạo cơ quan thuế các cấp tăng cường kỷ cương kỷ luật, chấn chỉnh lề lối làm việc, thái độ, tác phong ứng xử của cán bộ thuế với người nộp thuế (NNT) và đẩy mạnh cải cách hành chính, giảm chi phí tuân thủ cho NNT, tạo ra đợt sinh hoạt chính trị sâu rộng trong toàn bộ hệ thống, nhờ đó tạo bước chuyển biến căn bản trong chấp hành chế độ công vụ và phục vụ NNT của công chức thuế.
Về chính sách thuế, ngành Thuế sẽ tiếp tục sửa đổi, bổ sung và tái cơ cấu hệ thống chính sách thuế theo hướng đơn giản, đồng bộ, thống nhất, công bằng, hiệu quả, chủ động hội nhập kinh tế khu vực và quốc tế; thực hiện mức động viên hợp lý từ thuế, phí và lệ phí vào ngân sách nhà nước, mở rộng cơ sở thuế để phát triển nguồn thu, bao quát các nguồn thu mới phát sinh và cơ cấu lại theo hướng tăng tỷ trọng thu nội địa (không kể thu từ dầu thô) trong tổng thu NSNN.
Về quản lý thuế, sẽ tiếp tục hoàn thiện thể chế quản lý thuế nhằm thực hiện đơn giải hoá TTHC, tạo thuận lợi cho người nộp thuế tuân thủ pháp luật thuế, giảm chi phí tuân thủ cho người nộp thuế, phấn đấu đến năm 2020 Việt Nam là 1 trong 4 nước đứng đầu khu vực Đông Nam Á được xếp hạng có mức độ thuận lợi về thuế. Tái thiết kế quy trình nghiệp vụ quản lý thuế trên cơ sở ứng dụng công nghệ thông tin đảm bảo thống nhất, có tính liên kết cao.
Bên cạnh đó, áp dụng các hình thức tuyên truyền, hỗ trợ người nộp thuế phù hợp với từng nhóm người nộp thuế. Xây dựng, triển khai đa dạng các dịch vụ hỗ trợ người nộp thuế thực hiện TTHC thuế, trong đó chú trọng cung cấp các dịch vụ thuế điện tử cho người nộp thuế.
Xây dựng và áp dụng phương pháp quản lý rủi ro đối với các nghiệp vụ quản lý thuế, gồm: Đăng ký thuế; khai thuế; nộp thuế; nợ thuế và cưỡng chế thi hành quyết định hành chính thuế; hoàn thuế; kiểm tra; thanh tra thuế; tạo, in, phát hành, quản lý và sử dụng ấn chỉ thuế và các nghiệp vụ quản lý thuế khác trong quá trình thực hiện các hoạt động nghiệp vụ.
Ngoài ra, xây dựng cơ sở dữ liệu người nộp thuế đầy đủ, chính xác, tập trung thống nhất trên phạm vi cả nước; phát triển ứng dụng công nghệ thông tin hỗ trợ các hoạt động quản lý thuế đảm bảo tính liên kết, tự động hóa cao…